Жеребьевка этих стадий еврокубка начнется шестого июля в 14:00 по центральноевропейскому времени в штаб-квартире УЕФА в Ньоне.

Действующий чемпион "Бенфика", а также "ВИЗ-Синара", "Мурсия" и "Кайрат" на правах сеяных команд получили пропуск сразу в элитный раунд, тогда как оставшиеся 44 клуба вступят в борьбу раньше. Для 17 команд включая победителя Кубка УЕФА-2004/05 "Аксьон-21" и бронзового призера прошлого розыгрыша "Араза" турнир стартует с основного раунда. Его участники будут разбиты на шесть групп, матчи которых пройдут с 25 сентября по 3 октября. Хозяевами мини-турниров станут "Хрудим" (Чехия), "Тайм" (Украина), "Братислава" (Словакия), "Монтезильвано" (Италия), "Экономац" (Сербия), "Тыргу-Муреш" (Румыния).

В основной раунд также попадут победители семи групп предварительного раунда, который продлится с 14 по 22 августа. Все 27 его участников будут поделены на шесть квартетов, а еще в одной группе борьбу поведут три команды. На этом этапе хозяевами мини-турнира будут "Наутара" (Литва), "Дьор" (Венгрия), "Арарат" Никосия (Кипр), "Стелла Росса" (Австрия), "Железарец" (БЮР Македония), "Эксесс" (Мальта) и "Кефлавик" (Исландия). Окончательный список участников, сеяных команд, а также расписание жеребьевок будут оглашены по окончании всех чемпионатов.